Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms