Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTBSQ01459 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTBSQ01459 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms