Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAT1AQ00266 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms