Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRP54P61011 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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