Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAPAP54920 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAPAP54920 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAPAP54920 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAPAP54920 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NAPAP54920 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms