Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PGDP52209 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGDP52209 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGDP52209 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms