Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECHS1P30084 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms