Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB9P17482 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB9P17482 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms