Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTNSO60931 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms