Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDIL3O43854 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms