Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VGLL3A8MV65 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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