Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USH1CQ9Y6N9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USH1CQ9Y6N9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USH1CQ9Y6N9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms