Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
AP4B1Q9Y6B7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4B1Q9Y6B7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4B1Q9Y6B7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms