Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AUP1Q9Y679 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms