Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRRAPQ9Y4A5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms