Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRG3Q9Y2Y8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG3Q9Y2Y8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRG3Q9Y2Y8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms