Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP20Q9Y2K6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP20Q9Y2K6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP20Q9Y2K6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms