Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ICE1Q9Y2F5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ICE1Q9Y2F5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ICE1Q9Y2F5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms