Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC5Q9UQL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HDAC5Q9UQL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HDAC5Q9UQL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HDAC5Q9UQL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HDAC5Q9UQL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms