Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMC3Q9UQE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC3Q9UQE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SMC3Q9UQE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC3Q9UQE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms