Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC12A4Q9UP95 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A4Q9UP95 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms