Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VANGL2Q9ULK5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VANGL2Q9ULK5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL2Q9ULK5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms