Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
INO80Q9ULG1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
INO80Q9ULG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
INO80Q9ULG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms