Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NRXN1Q9ULB1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NRXN1Q9ULB1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NRXN1Q9ULB1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NRXN1Q9ULB1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms