Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO3Q9UK99 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO3Q9UK99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO3Q9UK99 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms