Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBE1Q9UJT0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBE1Q9UJT0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBE1Q9UJT0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms