Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH22Q9UJ99 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH22Q9UJ99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH22Q9UJ99 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH22Q9UJ99 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms