Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRAQ9UJ68 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSRAQ9UJ68 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSRAQ9UJ68 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms