Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFMBT1Q9UHJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFMBT1Q9UHJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms