Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPS1Q9UHF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPS1Q9UHF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms