Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
MLH3Q9UHC1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MLH3Q9UHC1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MLH3Q9UHC1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MLH3Q9UHC1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms