Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CFDP1Q9UEE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFDP1Q9UEE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFDP1Q9UEE9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms