Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX1-2Q9UD57 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKX1-2Q9UD57 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms