Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9Q9P2J2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGSF9Q9P2J2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGSF9Q9P2J2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms