Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC49.35■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC49.34■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC49.34■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC49.34■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.33■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC49.33■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.33■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC49.31■■■■■ 5.49
CCDC180Q9P1Z9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.3■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC49.29■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.27■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC49.26■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC49.26■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC49.26■■■■■ 5.48
CCDC180Q9P1Z9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC49.24■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC49.23■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
CCDC180Q9P1Z9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC49.18■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC49.17■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC49.16■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC49.15■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC49.11■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC49.1■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC49.09■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC49.08■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC49.08■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
CCDC180Q9P1Z9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCDC180Q9P1Z9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC49.05■■■■■ 5.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms