Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALCOCO1Q9P1Z2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CALCOCO1Q9P1Z2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALCOCO1Q9P1Z2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms