Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PHRF1Q9P1Y6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PHRF1Q9P1Y6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms