Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKD2L1Q9P0L9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKD2L1Q9P0L9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKD2L1Q9P0L9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms