Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPHK1Q9NYA1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPHK1Q9NYA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms