Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBCCD1Q9NVR7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TBCCD1Q9NVR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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