Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
INTS9Q9NV88 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INTS9Q9NV88 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INTS9Q9NV88 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms