Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMP3Q9NV31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMP3Q9NV31 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP3Q9NV31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP3Q9NV31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms