Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM140Q9NV12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM140Q9NV12 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM140Q9NV12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms