Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GINM1Q9NU53 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GINM1Q9NU53 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms