Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BIN3Q9NQY0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BIN3Q9NQY0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms