Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM9BQ9NQ34 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9BQ9NQ34 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms