Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRC4Q9NPP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRC4Q9NPP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRC4Q9NPP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms