Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NGRNQ9NPE2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NGRNQ9NPE2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms