Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PNPLA8Q9NP80 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNPLA8Q9NP80 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms