Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMX1Q9NP08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HMX1Q9NP08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMX1Q9NP08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HMX1Q9NP08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMX1Q9NP08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms